Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CEP290O15078 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP290O15078 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP290O15078 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP290O15078 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CEP290O15078 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CEP290O15078 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CEP290O15078 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CEP290O15078 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CEP290O15078 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CEP290O15078 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP290O15078 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CEP290O15078 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CEP290O15078 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP290O15078 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP290O15078 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP290O15078 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP290O15078 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP290O15078 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP290O15078 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP290O15078 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP290O15078 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP290O15078 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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