Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFAP73A6NFT4 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms