Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM247A6NEH6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms