Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP4B1Q9Y6B7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP4B1Q9Y6B7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP4B1Q9Y6B7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP4B1Q9Y6B7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
AP4B1Q9Y6B7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP4B1Q9Y6B7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP4B1Q9Y6B7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4B1Q9Y6B7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4B1Q9Y6B7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4B1Q9Y6B7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4B1Q9Y6B7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4B1Q9Y6B7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4B1Q9Y6B7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4B1Q9Y6B7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4B1Q9Y6B7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP4B1Q9Y6B7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms