Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CEP164Q9UPV0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CEP164Q9UPV0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms