Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms