Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CPNE7Q9UBL6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CPNE7Q9UBL6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CPNE7Q9UBL6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CPNE7Q9UBL6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CPNE7Q9UBL6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CPNE7Q9UBL6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CPNE7Q9UBL6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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