Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP35Q9P2H5 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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