Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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