Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA4CQ9C0C4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms