Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC106Q9BWC9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms