Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV73

CEP250, Centrosome-associated protein CEP250, humanhuman

Predictions only

Length 2,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP250Q9BV73 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP250Q9BV73 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP250Q9BV73 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms