Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFHD1Q9BUP0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms