Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms