Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SEC22CQ9BRL7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SEC22CQ9BRL7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SEC22CQ9BRL7 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SEC22CQ9BRL7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22CQ9BRL7 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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