Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms