Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SHDQ96IW2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms