Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BORCS6Q96GS4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms