Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms