Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms