Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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PTPRUQ92729 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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PTPRUQ92729 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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PTPRUQ92729 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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PTPRUQ92729 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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PTPRUQ92729 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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