Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM41Q8WV44 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms