Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms