Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms