Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms