Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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RNF148Q8N7C7 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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RNF148Q8N7C7 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF148Q8N7C7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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RNF148Q8N7C7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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RNF148Q8N7C7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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RNF148Q8N7C7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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