Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN4BQ8IWT1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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