Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BHLHA9Q7RTU4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHA9Q7RTU4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms