Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP9Q7RTR0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms