Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms