Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRIG3Q6UXM1 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms