Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC021517.1-202ENST00000585897 2111 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 FAIM2-205ENST00000550890 2094 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms