Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q6P435 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q6P435 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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