Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MLIPQ5VWP3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms