Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms