Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms