Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PXDC1Q5TGL8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms