Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC93Q567U6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms