Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms