Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 UGT1A8-201ENST00000373450 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 FGF11-202ENST00000572907 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ATP11AUN-201ENST00000623100 2241 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms