Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms