Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SP6Q3SY56 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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