Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms