Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 RAB13-201ENST00000368575 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 IQCF6-201ENST00000398780 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AL162724.1-201ENST00000437461 373 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 ATP5G1P7-201ENST00000444398 400 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AP001922.6-201ENST00000532553 546 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC004803.1-202ENST00000545629 569 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC005580.1-201ENST00000592311 583 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC020663.2-201ENST00000592465 720 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 Metazoa_SRP.168-201ENST00000621608 264 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 PUDPP2-202ENST00000628080 737 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP20-1Q3LI63 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 FAM173B-207ENST00000511437 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 MDP1-201ENST00000288087 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 HLA-DRA-201ENST00000374982 1169 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms