Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COL24A1Q17RW2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms