Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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