Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRNQ16849 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms