Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC6Q16204 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms