Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITSN1Q15811 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
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