Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms